微生物群落在所有生态系统中都发挥着重要的作用，但对控制这些群落组装的生态过程却缺乏全面的了解。为了解析微生物之间的生物相互作用在土壤微生物群组装和功能中的作用，作者使用了一种基于去除自然土壤微生物群落中的不同种群方法。作者假设，去除某些微生物群将强烈影响许多其他微生物群的相对适应度，从而阐明生物相互作用在塑造土壤微生物群中的贡献。
研究表明，39%的优势细菌类群在土壤再接种过程中受到了竞争相互作用，这凸显了生物相互作用在土壤微生物群落组装中的重要性。此外，这一方法能够识别微生物群落的组装规律，例如Bacillales和Proteobacteriales成员之间的竞争排除。改变生物相互作用对氮循环的改变大于碳循环相关的活性变化。该方法为研究复杂生态系统中的微生物相互作用以及微生物群落组成与生态系统功能之间的联系提供了一条新途径。
