我国是一个传统的农业国家，施用
有机肥料是农业生产的优良传统。在农作物营养套餐肥中一个极为重要的原则就是
有机肥与无机肥并重，才能极大地提高肥料的肥效及经济效益，实现农业的“高产、优质、高效、生态和安全”5大战略目标。
有机肥料是耕地土壤有机质的主要来源，也是农作物养分的直接供应者。大量的实践表明，有机肥料在供应作物有效营养成分和培肥改良土壤等方面的独特作用是化学肥料根本无法代替的。
有机肥料是完全肥料
有机肥料中含有丰富的有机质及各种农作物所需要的营养元素，不仅含有大量营养元素，还含有养分齐全的中微量营养元素。首先是氮素营养在化肥工业未兴起前，土壤氮素的补给几乎全部依赖于有机肥料，在化肥生产水平高的条件下，有机肥料在补给土壤氮素上仍占相当重要的位置。
虽然有机肥料中的氮素有效性低于化肥，可是施入土壤后，其氮素的损失率则较低，这就使得氮素能更多地存留在土壤中。因此，施用有机肥料比施用化肥更有助于保持和提高土中氮的储量。
至于有机肥料中的磷，可直接补充土壤中的有效磷，尤其是猪牛粪中的磷对当季利用率可为过磷酸钙或磷酸二氢钾的75%或更高。有机肥料中的有机酸可促进土壤中难溶性磷酸盐的溶解，并具有络合或螯合土壤中钙镁铁铝等离子的能力，使其形成稳定性化合物，减少磷被固定。
有机肥料中的钾呈无机态存在，故其有效性高。此外，有机肥料还能补充土壤中的钙、镁及微量元素等营养元素，并使其大多具有较高有效性。
补给和更新土壤有机质
有机质多少是土壤肥力高低的重要标志。丰富的土壤有机质是作物高产稳产低成本的一个必要条件。因为，施用有机肥料是补给和更新土壤有机质的重要手段。据统计，我国南方耕地土壤中由有机肥转化来的土壤有机质占土壤有机质年生成量的三分之二。据研究，土壤有机质的年生成量取决于每年进入土壤的有机物质数量和各种有机物质的腐殖化系数。
改善土壤理化性状
1.改善土壤结构性状。有机肥料进入土壤后，经过微生物作用能缩合形成新的腐殖质，与土粒有较强的复合能力，能增加有机无机复合度，显著促进土壤水稳性团聚体的形成，有效地改善和提高土壤结构性。据中国农业科学院土壤肥料研究所研究，施用绿肥、秸秆或者两者各半混合施用的，都可增加大于0.25mm团聚体的数量及其水稳性。试验中以绿肥与秸秆各半施用区最优杆施用区次之，绿肥施用区居第三位。
2.改善土壤物理性状。由于由有机质黏结的团聚体疏松多孔，水稳定性很高，吸水而不散开，为细土粒，和水分能同时被容纳在有结构的团粒内部和团粒之间。同时，有机质对土壤渗透度的影响和持水性有密切关系，可增强土壤保水率和毛管持水量，进而降低蒸发量。因此，施用有机肥料易协调土壤“三相(固相、液相、气相)”比例，从而能促进土壤养分转化，有利于作物根系伸展和对养分的吸收，提高土壤含水量，增强作物抗旱能力。对盐碱土来说，还能加速土壤脱盐，抑制返盐，改良土壤，培肥土壤。
提高土壤微生物和酶的活性
有机肥料腐烂分解后，可为土壤微生物的生命活动提供能量和养料，进而促进微生物繁殖，增强微生物的呼吸作用及氨化、硝化作用，还能增强土壤中脱氢酶、蛋白酶、脲酶、淀粉酶等的活性。
提高化肥的利用率
有机肥料中的有机质分解时会产生大量的有机酸。这些有机酸促进土壤和化肥中的矿物质养分的溶解，从而有利于农作物的吸收利用，显著提高化肥利用率。
刺激生长，改善品质，提高农作物的质量
有机肥分解过程中生成的一些酸性物质及生理活性物质，能够促进作物的种子发芽和根系生长。加上有机肥料中养分全面、丰富，尤其是含有最适合作物吸收利用的中微量营养元素、糖类、脂肪类及氨基酸等，显著改善作物产品的营养品质、食味品质、外观品质和降低食品硝酸盐含量。
据研究，有机肥料和无机肥料结合施用与常规施用方法相比，可提高小麦、玉米蛋白质含量2%-3.5%，氨基酸2.5%-3.2%，面筋1.4%-3.6%；可使烟叶中烟碱达2%-3%，含氯量＜1%，上、中等烟叶增产4%-20%；茶叶中水溶性糖、茶碱、茶多酚以及水溶性磷含量提高；大蒜优质率增加20%-30%，大蒜素含量提高0.9%-1.1%，蛋白质含量提高0.84%；
蔬菜中硝酸盐含量降低，维生素C含量提高；大豆中粗脂肪提高0.56%，亚油酸、油酸分别提高0.31%-0.92%。
影响农业生产的一个重要内容就是在底肥中配置一定数量的生态有机肥、生物有机肥等精制商品有机肥，实施有机肥与无机肥并重的施肥原则，实现补给土壤有机质、改良土壤结构、提高化肥利用率的目的。
